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　出力したい内容

EOD;

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上記のように書いても、ソースコードの色づけ、識別がうまくいかないように思います。
解決方法はありますか？

[ツール]メニューの[ページ編集オプション]をクリックして、[色の設定]タブに定義されていないものは設定不可能かと思います。

PHPで色分けができるものは以下の表示アイテムとなります。
・PHPキーワード
・PHPコメント
・PHPその他
・PHP演算子
・PHP関数
・PHP番号
・PHP文字列

Expression Webがヒアドキュメントを認識しなかった為に、
せっかくEW買ったのにまたEclipseに戻りましたorz

何？海外ではヒアドキュメント使わないの？
それともMSがPHPエディタとしての性能を落としてるの？

> Expression Webがヒアドキュメントを認識しなかった為に、
> せっかくEW買ったのにまたEclipseに戻りましたorz
>
> 何？海外ではヒアドキュメント使わないの？
> それともMSがPHPエディタとしての性能を落としてるの？

そのヒアドキュメントは <?php と ?> の間に記述されていますか？
もしその外であれば、Webページとして認識されます。

> Expression Webがヒアドキュメントを認識しなかった為に、
> せっかくEW買ったのにまたEclipseに戻りましたorz
>
> 何？海外ではヒアドキュメント使わないの？
> それともMSがPHPエディタとしての性能を落としてるの？

まず、その問題のサンプルを提示していただけませんか？
このコードであれば必ず問題が再現するというサンプルを提示していただければ、
たぶんバグとして処理されるかと思います。

少なくとも、もぎゃ氏（http://mogya.com/）によるPHPスクリプトに含まれるヒアドキュメントはちゃんと認識しています。

よろしくお願いいたします。